微生物采样器主要包括微生物采水器、采泥器和柱状取样管等。微生物采水器用于采集海水中的微生物样品，由机架和采水瓶两部分组成，将其沉放到预定深度时，投放下坠铁块敲击杠杆后部，杠杆前端挑起，将玻璃管击断，使海水进入采水器瓶内。复背式采水器由一个厚壁橡皮球附加在颠倒采水器上构成，采水器颠倒时，把球口上的塞子拉下，海水进入橡皮球中。无菌采水袋由无菌塑料袋和采水机架组成，采水袋沉放到预定采水深度时，使锤或切刀将水嘴打开，海水流入。采泥器和柱状取样管也可用来采集底质中的微生物样品。
微生物采样器功能技术：
（1）采样功能：可实现等时混合采样、流量等比例采样（配的流量探头）、任意超标因子（COD、氨氮、总磷、总氮、重金属等）外控采样、远程控制随机采样等多种采样方式。
（2）分瓶留样功能：可实现1～24瓶任意留样，留样瓶数和方式可自由设定。
（3）供样功能：可向COD、氨氮、总磷、总氮、重金属等多台在线监测仪同时提供等时混合水样，缓存盒自带搅拌混匀功能。
（4）排空润洗功能：系统可自动排空缓存盒内存水，下次采样前可自动反吹及润洗采样管路，保证管路通畅和每次采集样品真实性和代表性。
（5）采样信息记录功能：可记录每次留样时间、瓶号、留样量、超标信息等，可记录8000条数据，循环更新。
（6）通信功能：RS-232、RS-485；4mA～20mA。
（7）断电保护功能：仪器在运行状态突然下断电并重新上电后，仪器能自动恢复原运行状态，断电后仪器参数不丢失。
（8）开关门记录：可检测采样器的开关门状态并记录每次开关门的时间，可记录新的2000条数据记录。
（9）停电记录：可记录仪器断电和上电的时间，可记录新的2000条数据。
（10）语音播报功能。
（11）打印功能。
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